La purificación de una sustancia por cromatografía en columna (CC) en microescala se puede realizar de dos formas. Bien usando una columna adaptada a la cantidad de sustancia que se va a purificar, o mediante una pipeta Pasteur preparada a tal efecto con un relleno de gel de sílice o alúmina.
Los equipos Kontes-Williamson disponen de cromatografía en columna (CC) en microescala, especialmente diseñadas para la separación de pequeñas cantidades de muestra. Sin embargo, se pueden utilizar igualmente cualquier columna del tamaño apropiado para las cantidades de sustancia a separar.
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